Sammaltaimede kogu koosneb Eesti herbaariumist ja välisherbaariumist ning selles on ca 37 000 samblaproovi. Herbaariumis on esindatud 1386 samblaliiki ning 30 varieteeti või alamliiki. Eestist pärit materjali on 590 liiki ja alam taksonit.
EESTI HERBAARIUM moodustab suurema osa kogust ning pärineb peamiselt ajavahemikust 1945. aastast praeguseni.
Ajalooline osa kogust pärineb 19. sajandist ja 20. sajandi algusest. Kokku ligikaudu 7700 eksemplari.
- Edmund Russowi turbasammalde kogu (4237 eksemplari)
- J.Micutowiczi turbasammalde kogu (226 eksemplari)
- Eesti Looduseuurijate Seltsi samblaherbaarium (244 liiki), kogunud Andreas Bruttan.
- Eugen Niclaseni herbaarium (490 liiki)
- Karl Girgensohni herbaarium (2506 eksemplari)
VÄLISHERBAARIUMIS on arvele on võetud ligi 2300 samblaproovi. Omaette piirkondadena on eristatud: Baltikum, Euroopa, Skandinaavia, Venemaa, Kaukaasia, Aasia, Siber, Kaug-Ida, Aafrika, Austraalia, Lõuna-Ameerika, Põhja-Ameerika ja Arktika.
Austraalia kogu on suur ja koosneb Heinar Streimanni kogutud proovidest Austraalia erinevatest piirkondadest, Uus-Meremaalt, Tasmaanialt, Paapuast ja Norfolkilt. Lõuna-Ameerika kogu koosneb põhiliselt Schäfer-Verwimpi Brasiiliast kogutud sammaldest. Lisaks on samblaproove Panamast (Nele Ingerpuu) ja Peruust (Leiti Kannukene). Arktika proovidest suur osa on saadud Eesti Loodusmuuseumist duplumitena (Taimõr) ja osa Venemaalt saadetud eksikaatkogudest erinevate Arktika piirkondade kohta.
EKSIKAATKOGUD
Eksikaatkogudes on kokku 1325 samblaproovi.
- Flora Exsiccata Liv-, Est- und Curlands. Herb. Hugo Kapp, 19. saj. (165 eks.)
- Musci Frondosi Exsiccati (Euroopa) Karl Friedrich Bernhard Fiedler 1842–1848 (50 eks.)
- Musci Frondosi Exsiccati (Euroopa) Karl Friedrich Bernhard Fiider 1847–1848 (385 eks.)
- Bryotheca Polonica, Nr.201–250, Antoni Józef Żmuda Krakow, 1930 (50 eks.)
- Hepaticae et Musci URSS Exiccati, Nr. 1–50, Leningrad,1957, Nr.51–190, Leningrad, 1961–1962 (254 eks.)
- Bryophyta Murmanica Exsiccata Fasc I, Nr. 1–50, Fasc. III Nr. 101–150 Kirovsk, 1989; Fasc. III Nr. 101–150 Kirovsk 1998. (98 eks.)
- Bryophyta Rossica et Civitatum Collimitanearum Exsiccata Fasc. I–IV, Nr. 1–100, St.-Petersburg, 1995 (100 eks.)
- Bryophyta Karelica Exsiccata Nr. 1–50 (51 eks.)
- Musci Ausralasiae Exsiccati, Canberra, 1992–1997 (105 eks.)
- Bryotheca Europaea – Die Laubmoose Europa’s, L.Rabenhorst, 1861 Fasc.IX. Nr.401 – 450 Dresden, Druck von G.(?) Heinrich (63 eks.)